根據國家棉花質量檢驗體制改革方案和中纖局儀器化公證檢驗實施計劃，昌吉州纖檢所被列為 2005年中國棉花公證檢驗承檢單位。為確保棉花儀器化公證檢驗實驗室建設及儀器設備的購置、管理安裝調試工作順利完成，昌吉州纖檢所領導高度重視，成立了以所長為組長的“棉花儀器化公證檢驗領導小組”，實驗室改造工程6月15日正式動工，歷時4個月，完成了630余平米實驗室改建，增加了一臺250KW變壓器專供“棉花儀器化公證檢驗”工作，配置兩臺恒溫濕空調機組、兩臺HVI1000檢測設備經及其它輔助設施，培訓專職的HVI儀器操作員、維修人員信息化管理人員及技術負責人等18余人次。 目前，投資600余萬元的“中國棉花儀器儀化公證檢驗昌吉實驗室”現已正式投入使用。今年昌吉州纖維檢驗所將對轄區范圍內的4家棉花加工企業的1萬余噸皮棉實施免費儀器化公證檢驗。 實驗室的投入使用為推動昌吉棉花產業的發展，為棉花的生產、加工及銷售業提共及時、公證、科學的質量保證，為昌吉經濟建設將產生重要的影響。