質量目標是在質量方針和實驗室戰略策劃的大框架下實驗室追求的質量方面的目標。質量方針可以是抽象的，質量目標則是可測度、可實現、可衡量、具體的，包括具體目標的類別和項目、目標值的定位以及實現目標的時間區間等。實驗室最高管理者應在體系策劃過程中依據實驗室的質量方針制定能夠導致機構業績改進的質量目標，且應對實驗室的相關職能和層次分別規定質量目標。

　　一般寫入質量手冊的目標應是中長期目標（3～5年）。如果在質量手冊中同時給出長遠目標和中長期目標，也是可以的，但由于形勢的發展，供方需求在不斷發生變化，機構也可能作出一些調整，更長時期的質量目標不易把握，因而3～5年是比較適宜的。為實現這一中長期質量目標，實驗室還可以制定年度目標、階段性目標。年度目標屬短期目標，不必在質量手冊中出現，實驗室應在年度計劃中提出年度質量目標，如證書差錯率、顧客滿意率等，在下次管理評審時對質量目標的完成情況進行評估，以利于質量改進的實施。